1° Saison (1993-1994)

01 Nous ne sommes pas seuls

02 Gorge profonde

03 Compressions

04 L'enlèvement

05 Le diable du New Jersey

06 L'ombre de la mort

07 Un fantôme dans l'ordinateur

08 Projet Arctique

09 Espace

10 L'ange déchu

11 Eve

12 L'incendiaire

13 Le message

14 Masculin-féminin

15 Lazare

16 Vengeance d'outre-tombe

17 Entité biologique extraterrestre

18 L'église des miracles

19 Métamorphoses

20 Quand vient la nuit

21 Le retour de Tooms

22 Renaissance

23 Roland

24 Les hybrides

2° Saison (1994-1995)

25 Les petits hommes verts

26 L'hôte

27 Mauvais sang

28 Insomnies

29 Duane Barry

30 Duane Barry (2)

31 Les vampires

32 Coma

33 Intra-terrestres

34 Le musée rouge

35 Excelsis Dei

36 Aubrey

37 Le fétichiste

38 La main de l'enfer

39 Mystère vaudou

40 La colonie

41 La colonie (2)

42 Parole de singe

43 Le vaisseau fantôme

44 Faux frères siamois

45 Les Calusaris

46 F Emasculata / Contamination

47 Ombre mortelle

48 Une petite ville tranquille

49 Anasazi

3° Saison (1995-1996)

50 Le chemin de la bénédiction

51 Opération presse-papiers

52 Coup de foudre

53 Voyances par procuration

54 La liste

55 Meurtres sur Internet

56 Corps astral

57 Souvenir d'oubliette

58 Monstres d'utilité publique

59 Monstres d'utilité publique (2)

60 Révélations

61 La guerre des coprophages

62 Ames damnées

63 Le visage de l'horreur

64 L'épave

65 L'épave (2)

66 Autosuggestion

67 Malédiction

68 La règle du jeu

69 Le seigneur du magma

70 La visite

71 Les dents du lac

72 Incitation au meurtre / Hallucinations

73 Anagramme

4° Saison (1996-1997)

74 Tout ne doit pas mourir

75 Les hurleurs

76 La meute

77 Teliko

78 Le pré où je suis mort

79 Sanguinarium

80 L'homme à la cigarette

81 Coeurs de tissu

82 Tunguska

83 Tunguska (2)

84 El chupacabra

85 La prière des morts

86 Plus jamais

87 Régénérations

88 Journal de mort

89 L'homme invisible

90 Tempus Fugit

91 Tempus fugit (2)

92 Aux frontières du jamais

93 La queue du diable

94 Nid d'abeilles

95 Amour fou

96 Crime de mémoire

97 Le baiser de Judas

5° Saison (1997-1998)

98 Le complot

  99 La voie de la vérité

100 Les bandits solitaires

101 Détour

102 Prométhée post-moderne

103 Emily

104 Emily (2)

105 Kitsunegari

106 Schizogonie

107 La poupée

108 Clic mortel

109 Le shérif a les dents longues

110 Patient X

111 Patient X (2)

112 Compagnons de route

113 L'oeil de l'esprit

114 L'âme en peine

115 Les nouveaux spartiates

116 Folie à deux

117 La fin

X Files: le film

6° Saison (1998-1999)

118 Le commencement

119 Poursuite

120 Triangle

121 Zone 51

122 Zone 51 (2)

123 Les amants maudits

124 Pauvre diable

125 Le roi de la pluie

126 Compte à rebours

127 Photo mortelle

128 Toute la vérité

129 Toute la vérité (2)

130 Agua Mala

131 Lundi

132 Bienvenue en Arcadie

133 Entre chien et loup

134 Trevor

135 A coeur perdu

136 Le grand jour

137 Brelan d'as

138 Spores

139 Biogenèse

7° Saison (1999-2000)

140 La 6ème extinction

141 La 6ème extinction (2)

142 Appétit monstre

143 Millennium

144 A toute vitesse

145 Chance

146 Orison

147 Maleeni le prodigieux

148 La morsure du mal

149 Délivrance

150 Délivrance (2)

151 Peur bleue

152 Maitreya

153 Coup du sort

154 En ami

155 Chimère

156 Existences

157 Nicotine

158 Hollywood

159 Doubles

160 Je souhaite

161 Requiem

8° Saison (2000-2001)

162 Chasse à l'homme

163 Chasse à l'homme (2)

164 Patience

165 Un coin perdu

166 Invocation

167 Combattre le passé

168 Via negativa

169 A coup sûr

170 Dur comme fer

171 A l'intérieur

172 Dévoreur d'âmes

173 Luminescence

174 Per manum

175 Espérance

176 Renaissances

177 Confiance

178 Empedocles

179 Vienen

180 Seul

181 Essence

182 Essence (2)

9° Saison (2001-2002)

183 Nouvelle génération

184 Nouvelle génération (2)

185 Daemonicus

186 4 D

187 Le seigneur des mouches

188 Ne faites confiance à personne

189 Amnésie

190 Ecorchés

191 La prophétie

192 La prophétie (2)

193 Audrey Pauley

194 Dans les abîmes

195 Improbable

196 Une vue de l'esprit

197 N'abandonnez jamais

198 William

199 Clairvoyance

200 Irréfutable

201 La vérité est ici (90 mn)